崇明区外资公司注销过程中所需要做的税务清算审计：
1、对近三年在地方税务局缴纳的营业税、消费税、资源税、城建税、附加税、个人所得税、房产税、土地税（费）、印花税等所有税种进行纳税清算审计。
2、对近三年在国税局缴纳的增值税、所得税等所有税种进行清算审计。
3、对在国税局、地税局领购发票使用情况进行审计。
4、对企业清算所得税进行纳税鉴证。
5、对企业清算开始日和清算终止日报表进行审计，出具清算审计报告。

崇明区外资企业注销流程：
准备工作：股东（会）、执行董事（董事会）或经理（法定代表人）起草公司注销决定。成立清算组，确定清算组负责人，办理清算组工商备案。

首先：申请注销外资投资企业批准证书，取得商务委员会注销（提前终止）批复文件。
其次：清理公司财产，编制资产负债表和财产清单；通知、公告债权人（同时刊登注销公告）；处理与清算有关的公司未了结业务；清缴所欠税款和清算过程中产生的税款，清理债权、债务，结清职工工资保险等；处理公司清偿债务后的剩余财产。

再次注销税务登记，同时注销财政登记。1、注销地税登记，必须做近三年全税种的清税审计。2、注销国税登记，必须做清算所得企业所得税审计。然后，注销海关登记。

另外：刊登注销公告已过45日，且已经注销税务登记（地税和国税）和海关登记，并已经取得商务部门公司终止批复后，办理注销工商登记。

最后：取得工商注销通知书后，再依次办理以下注销登记。
1、注销外汇登记，清算所得按股权比例分配并汇出境外的必须做《清算审计报告》。
2、注销统计登记
3、注销组织机构代码
4、注销社会保险登记
5、注（撤）销银行账户
6、注销公安局《备案登记簿》